Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX7O95931 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX7O95931 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms