Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms