Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ZNF253O75346 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ZNF253O75346 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ZNF253O75346 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ZNF253O75346 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ZNF253O75346 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ZNF253O75346 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ZNF253O75346 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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