Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms