Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALUO43852 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALUO43852 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALUO43852 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALUO43852 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALUO43852 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALUO43852 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALUO43852 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALUO43852 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALUO43852 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALUO43852 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALUO43852 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALUO43852 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALUO43852 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms