Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms