Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN6O00399 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms