Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms