Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf58C9J3I9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms