Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DXG7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DXG7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DXG7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DXG7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DXG7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DXG7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DXG7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DXG7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DXG7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DXG7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DXG7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DXG7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DXG7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DXG7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DXG7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DXG7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DXG7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms