Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms