Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms