Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms