Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAD1L1Q9Y6D9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAD1L1Q9Y6D9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.4 ms