Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCTD3Q9Y597 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms