Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP15Q9Y4E8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP15Q9Y4E8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138 ms