Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKP3Q9Y446 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms