Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HCN4Q9Y3Q4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HCN4Q9Y3Q4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
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