Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT52Q9Y366 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT52Q9Y366 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms