Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3M1Q9Y2T2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms