Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ88

CDK11A, Cyclin-dependent kinase 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11AQ9UQ88 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CDK11AQ9UQ88 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CDK11AQ9UQ88 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
CDK11AQ9UQ88 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms