Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAPRE3Q9UPY8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAPRE3Q9UPY8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms