Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A1LQ9UNN4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A1LQ9UNN4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms