Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHA12Q9UN75 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCDHA12Q9UN75 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms