Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP18Q9UMW8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP18Q9UMW8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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