Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC7AQ9ULT0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC7AQ9ULT0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC7AQ9ULT0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC7AQ9ULT0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC7AQ9ULT0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC7AQ9ULT0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC7AQ9ULT0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC7AQ9ULT0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC7AQ9ULT0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC7AQ9ULT0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC7AQ9ULT0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC7AQ9ULT0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC7AQ9ULT0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC7AQ9ULT0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms