Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NRXN1Q9ULB1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NRXN1Q9ULB1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NRXN1Q9ULB1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms