Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ3

GPATCH8, G patch domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH8Q9UKJ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
GPATCH8Q9UKJ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
GPATCH8Q9UKJ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
GPATCH8Q9UKJ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms