Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCTN4Q9UJW0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DCTN4Q9UJW0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms