Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX41Q9UJV9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX41Q9UJV9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms