Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SALL4Q9UJQ4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms