Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV2

SERTAD1, SERTA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERTAD1Q9UHV2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SERTAD1Q9UHV2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SERTAD1Q9UHV2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SERTAD1Q9UHV2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SERTAD1Q9UHV2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SERTAD1Q9UHV2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SERTAD1Q9UHV2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SERTAD1Q9UHV2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SERTAD1Q9UHV2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SERTAD1Q9UHV2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SERTAD1Q9UHV2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SERTAD1Q9UHV2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SERTAD1Q9UHV2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SERTAD1Q9UHV2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SERTAD1Q9UHV2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SERTAD1Q9UHV2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SERTAD1Q9UHV2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SERTAD1Q9UHV2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SERTAD1Q9UHV2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SERTAD1Q9UHV2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SERTAD1Q9UHV2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SERTAD1Q9UHV2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SERTAD1Q9UHV2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SERTAD1Q9UHV2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SERTAD1Q9UHV2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SERTAD1Q9UHV2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SERTAD1Q9UHV2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SERTAD1Q9UHV2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SERTAD1Q9UHV2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SERTAD1Q9UHV2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SERTAD1Q9UHV2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SERTAD1Q9UHV2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SERTAD1Q9UHV2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms