Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDP2Q9P2J9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms