Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP36Q9P275 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP36Q9P275 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms