Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PHRF1Q9P1Y6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
PHRF1Q9P1Y6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PHRF1Q9P1Y6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms