Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU0

FLRT3, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT3, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLRT3Q9NZU0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLRT3Q9NZU0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLRT3Q9NZU0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLRT3Q9NZU0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLRT3Q9NZU0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FLRT3Q9NZU0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLRT3Q9NZU0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLRT3Q9NZU0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLRT3Q9NZU0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLRT3Q9NZU0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLRT3Q9NZU0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FLRT3Q9NZU0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FLRT3Q9NZU0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FLRT3Q9NZU0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FLRT3Q9NZU0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FLRT3Q9NZU0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FLRT3Q9NZU0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FLRT3Q9NZU0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLRT3Q9NZU0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLRT3Q9NZU0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms