Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP1Q9NZI2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP1Q9NZI2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms