Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLCO1C1Q9NYB5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms