Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GIN1Q9NXP7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GIN1Q9NXP7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms