Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOR4AQ9NXH8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOR4AQ9NXH8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOR4AQ9NXH8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOR4AQ9NXH8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOR4AQ9NXH8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOR4AQ9NXH8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOR4AQ9NXH8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOR4AQ9NXH8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOR4AQ9NXH8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOR4AQ9NXH8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOR4AQ9NXH8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOR4AQ9NXH8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOR4AQ9NXH8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOR4AQ9NXH8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms