Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW75

GPATCH2, G patch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH2Q9NW75 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPATCH2Q9NW75 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPATCH2Q9NW75 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPATCH2Q9NW75 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms