Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBRD1Q9NUN5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBRD1Q9NUN5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms