Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARSBQ9NSD9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FARSBQ9NSD9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARSBQ9NSD9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARSBQ9NSD9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARSBQ9NSD9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARSBQ9NSD9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARSBQ9NSD9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARSBQ9NSD9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARSBQ9NSD9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms