Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER3Q9NSC5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOMER3Q9NSC5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms