Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB6BQ9NRW1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms