Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC52A3Q9NQ40 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms