Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NRIP3Q9NQ35 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms