Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST11Q9NPF2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST11Q9NPF2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms