Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC24A3Q9HC58 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC24A3Q9HC58 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms