Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPV4Q9HBA0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPV4Q9HBA0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms